Chapitres 22:L'homme masqué Ed et Al doivent survivre pendant un mois sur une île déserte. Alors que leur sensei leur a dit que l'île était inhabitée, ils sont attaqués par un homme masqué. On assiste ensuite au déroulement du mois passé sur cette île.... Chapitres 23:Devant la porte du Paradis Ed et Al ont fini leur entrînement avec leur sensei en seulement 6 mois ! Mais, leur capacité en alchimie ont vraiment énormément augmentées. Puis, ils essayent de réaliser la transmutation qui récussitera leur mère . Mais, lors de cette dernière il se passe quelque chose d'imprèvu, et Ed se retrouve devant une porte ou il pourra entre appercevoir ce que son sensei appelle le "vrai savoir".... Chapitres 24:L'alchimiste dacier Le Lt Mustang vient rendre visite aux frèeres Elric. Là, il se rend compte de ce qui vient de se passer et leur propose de devenir state alchemist, pour pouvoir faire des recherches sur comment regagner leur corps, du fait des immenses privilèges du au rang de State Alchemist. Pendant l'examen, Ed fait une pseudo tentative d'assassinat du furher, démontrant ainsi que la sécurité devrait être renforcée. Ed est reçu à l'examen et le furher lui donne un nom d'alchimiste que nous connaissons tous : The Full metal Alchemist.... Chapitres 25:Arrangements avec un apprenti En apprenent ce qu'il leur est arrivé, Izumi chasse Ed et Al, du fait de ce qu'ils ont fait. Mais, têtu comme ils sont, les frères Elric reviennent à la charge et demande à leur sensei si elle connait un moyen pour leur permettre de retrouver leurs corps originaux. Peu après, Al et Ed font la connaissance d'une chimère, qui va aller rapporter à un personnage énigmatique la présence des deux frangins à Dublith

Chapitres 26:Jusqu'au Leader Alors qu'un militaire déchu cherche des crosses à Scar, Alphonse est confronté aux hommes de mains de Greed, venus le capturer. Chapitrs 27:Les bêtes de Dublith Alors que Greed se présente à Alphonse, lui démontre ses pouvoirs et lui expose ses objectifs, Ed part rencontrer le fuhrer pour son examen. Chapitres 28:Le courage d'un homme ordinaire Izumi renonce à éliminer Greed, Edward prends sa releve, un titanesque combat s'annonce. Pendant ce temps, le Fuhrer et Armstrong attaque le Devil's nest . Chapitres 29:L'oeil du Führer Alors que l'armée élimine un à un les soldats de Greed sans la moindre pitié. Edward continue d'affronter celui-ci dans un sanglant combat.

Chapitres 30: La véritée cachée dans l'armure Le combat continue de faire rage au Devil's Nest, Greed et ses subordonnés se font littéralement massacrer par le furher. Al tente de dissuader Martel de faire du mal à Wrath, mais cette dernière se fait massacrer comme ces compagnions, Mais, à ce moment, Al parvient à voir ce qu'il s'est passé de l'autre coté de la porte, ce qu'il s'est passé lors de la transmutation de sa mère. A Central City, le Lt. Riza Hawkeye fait une drole de rencontre ... Chapitres 31:Le serpent qui dévore sa propre queue Le colonel Mustang et quelques un de ses hommes interrogent celui qui se dit être Barry The Chopper, et du fait de ses réponses, ils semblent arriver à la conclusion que ce dernier est bien celui qu'il dit être. Il leur apprend aussi pas mal de choses sur ce qu'il se passait dans le 5 ème laboratoire. A un autre endroit, on assiste à une réunion entre homonculus, et plus particulièrement à l'apparition de celui qu'ils appellent Père. Greed ne voulant pas rejoindre les rangs de ses anciens "frères" et "soeurs", il est décomposé dans une sorte de lave, pour ensuite devenir une sorte de boisson, pour son "Père"... Chapitre 32:L'émissaire de l'est Nous sommes de retour a la mine, qu'avait acheté Ed à Yoki. Là, le fils de l'aubergiste découvre une personne venant de Xian, en ayant traversé le désert. Peu après, une partie de la mine s'écroule, mais les personnes restantes à l'intérieur sont sauvées par la petite fille rencontrée précedemment, qui fait une démonstration d'alchimie époustouflante. A Rush valley, nos deux compagnions retrouve Winry, qui prends très mal le fait qu'Ed ait encore cassé son automail (elle manque de le tuer). Plus tard, nos deux frangins rencontrent un vagabond, qui après avoir mangé un copieux repas, leur annonce qu'il est à la recherche de la pierre pUne bataille à Rushvalley Aux prises avec cet étranger de Xion, les frères Elric sont contraints de livrer bataille contre les "ninjas" de ce mystérieux individu, qui semblent lui aussi rechercher la pierre philosophale. Connaissant nos deux héros, les deux sbires ne vont pas s'en tirer à si bon compte.hilosophale ..... Chapitres 33:Une bataille à Rushvalley Aux prises avec cet étranger de Xion, les frères Elric sont contraints de livrer bataille contre les "ninjas" de ce mystérieux individu, qui semblent lui aussi rechercher la pierre philosophale. Connaissant nos deux héros, les deux sbires ne vont pas s'en tirer à si bon compte.

Chapitres 34:Sur les traces d'un camarade Mustang commence à se poser des questions sur le bien fondé des actions des militaires, et reste marqué par la mort de Hugues, chose qu'Armstrong n'a toujours pas pu annoncer aux garçons. Ceux-ci font connaissances avec les mystérieux arrivants de l'Est dans le train les menant à Central. Havoc continue de s'occuper de Barry The Chopper et semble s'être trouvé une copine. Chapitres 35:Le bouc émissaire Mustang n'a pas pu dire aux garçons que Hugues était mort, mais ceux-ci l'apprendront par la presse. L'enquête sur le meurtre de celui-ci semble tourner en une conspiration contre Ross. Barry s'évade et libère Ross et Rin par la même occasion. Mais ils tombent sur les frères Elric, et puis fatalement sur... Mustang. Chapitres 36:L'alchimiste de glace Ed et Mustang se seraient battus, si Al ne les avait pas séparés. Mustang s'excuse pour avoir caché la mort d'Hugues et explique froidement que tuer Maria répondait à un ordre. Armstrong lui aussi est sur le point de s'énerver contre Mustang mais se contient. Les Frères et Winry décident de rendre visite à la veuve d'Hugues et sa fille où ils apprendront une importante leçon de vie. Pendant ce temps, les Homunculus projettent quelque chose contre Barry The Chopper. Chapitres 37:Le corps du pêcheur Mustang semble préparer un rendez-vous amoureux. Alors qu'Ed et Al réfléchissent à ce qu'ils comptent faire : « Est-ce que nous voulons toujours récupérer nos corps si cela doit causer la mort d'autres personnes ? » , Armstrong se pointe et essaye d'emmener Ed loin de Central. Pendant ce temps, l'ancien corps de Barry semble attaquer celui-ci qui est, rappelons le, dans un corps de Metal à l'instar d'Al. Havoc s'en mele et essaye de stopper le corps.

Chapitres 38:Le corps du pêcheur Mustang semble préparer un rendez-vous amoureux. Alors qu'Ed et Al réfléchissent à ce qu'ils comptent faire : « Est-ce que nous voulons toujours récupérer nos corps si cela doit causer la mort d'autres personnes ? » , Armstrong se pointe et essaye d'emmener Ed loin de Central. Pendant ce temps, l'ancien corps de Barry semble attaquer celui-ci qui est, rappelons le, dans un corps de Metal à l'instar d'Al. Havoc s'en mele et essaye de stopper le corps. Chapitres 39:Les complexités du Central Le combat s'annonce difficile pour Mustang, qui se fait battre par Lust. Cette dernière vas ensuite rendre une petite visite à Riza et Al, mais n'as pas le temps de les tuer, grace à l'intervention de Al et aussi de Mustang, qui tue l'homonculus Lust.. Chapitres 40:Les sages de l'ouest Le combat est fini, pendant ce temps, les homonculus se sont retire dans leur QG et leur « père » fait une sortie. Pendant ce temps, Ed va visiter les ruines de Xeres, ou il retrouve Maria Ross. Pendant ce temps, à l'hopital, Mustang et Havoc se remettent de leur blessures. Chapitres 41:Les obstacles que créent les promesses Ed est toujours dans les ruines de Xeres, il en découvre un peu plus sur la manière dont à été maquillé le meurtre de Maria Ross, et apprend aussi ce que faisait Hugues avant d'être tué. Un peu plus tard, en contemplant le symbole présent dans ces ruines, il rencontre des Ishvarites, qui lui en apprennent un peu plus sur la mort des parents de Winry.